Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms