Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RSPO3Q9BXY4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RSPO3Q9BXY4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RSPO3Q9BXY4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RSPO3Q9BXY4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSPO3Q9BXY4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSPO3Q9BXY4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSPO3Q9BXY4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSPO3Q9BXY4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSPO3Q9BXY4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSPO3Q9BXY4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSPO3Q9BXY4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSPO3Q9BXY4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSPO3Q9BXY4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSPO3Q9BXY4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSPO3Q9BXY4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms