Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP1Q9BWH6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP1Q9BWH6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms