Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG101Q9BSB4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms