Protein–RNA interactions for Protein: Q99758

ABCA3, ATP-binding cassette sub-family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA3Q99758 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCA3Q99758 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABCA3Q99758 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABCA3Q99758 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABCA3Q99758 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABCA3Q99758 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCA3Q99758 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCA3Q99758 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCA3Q99758 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCA3Q99758 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCA3Q99758 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCA3Q99758 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCA3Q99758 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCA3Q99758 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCA3Q99758 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCA3Q99758 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCA3Q99758 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCA3Q99758 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCA3Q99758 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCA3Q99758 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCA3Q99758 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCA3Q99758 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms