Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms