Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC22A12Q96S37 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms