Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms