Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms