Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms