Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms