Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTHRC1Q96CG8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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