Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms