Protein–RNA interactions for Protein: Q969D9

TSLP, Thymic stromal lymphopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSLPQ969D9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSLPQ969D9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms