Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TOPBP1Q92547 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms