Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATAD2BQ8WXI9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms