Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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FAM71DQ8N9W8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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FAM71DQ8N9W8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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FAM71DQ8N9W8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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FAM71DQ8N9W8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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