Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF182Q8N6D2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms