Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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