Protein–RNA interactions for Protein: Q8N126

CADM3, Cell adhesion molecule 3, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM3Q8N126 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CADM3Q8N126 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CADM3Q8N126 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms