Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms