Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KNDC1Q76NI1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms