Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
REEP3Q6NUK4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms