Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LRRC8EQ6NSJ5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
LRRC8EQ6NSJ5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LRRC8EQ6NSJ5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC8EQ6NSJ5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC8EQ6NSJ5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC8EQ6NSJ5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC8EQ6NSJ5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC8EQ6NSJ5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC8EQ6NSJ5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC8EQ6NSJ5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC8EQ6NSJ5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC8EQ6NSJ5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC8EQ6NSJ5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC8EQ6NSJ5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC8EQ6NSJ5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC8EQ6NSJ5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC8EQ6NSJ5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC8EQ6NSJ5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms