Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms