Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms