Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms