Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms