Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms