Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5M9

CCNJ, Cyclin-J, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJQ5T5M9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNJQ5T5M9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms