Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q56UQ5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q56UQ5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q56UQ5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q56UQ5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q56UQ5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q56UQ5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q56UQ5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q56UQ5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q56UQ5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q56UQ5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q56UQ5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q56UQ5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q56UQ5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q56UQ5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q56UQ5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q56UQ5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q56UQ5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q56UQ5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q56UQ5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q56UQ5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q56UQ5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q56UQ5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q56UQ5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q56UQ5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q56UQ5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q56UQ5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q56UQ5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q56UQ5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q56UQ5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q56UQ5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q56UQ5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q56UQ5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q56UQ5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q56UQ5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q56UQ5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q56UQ5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q56UQ5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q56UQ5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q56UQ5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q56UQ5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q56UQ5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q56UQ5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q56UQ5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q56UQ5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q56UQ5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q56UQ5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q56UQ5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q56UQ5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q56UQ5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q56UQ5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q56UQ5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q56UQ5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q56UQ5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q56UQ5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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