Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms