Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms