Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HFEQ30201 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HFEQ30201 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HFEQ30201 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HFEQ30201 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HFEQ30201 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HFEQ30201 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HFEQ30201 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HFEQ30201 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HFEQ30201 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HFEQ30201 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HFEQ30201 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HFEQ30201 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HFEQ30201 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HFEQ30201 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HFEQ30201 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HFEQ30201 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HFEQ30201 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HFEQ30201 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HFEQ30201 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HFEQ30201 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HFEQ30201 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HFEQ30201 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HFEQ30201 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HFEQ30201 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HFEQ30201 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HFEQ30201 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HFEQ30201 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HFEQ30201 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HFEQ30201 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HFEQ30201 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HFEQ30201 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HFEQ30201 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HFEQ30201 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HFEQ30201 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HFEQ30201 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HFEQ30201 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HFEQ30201 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HFEQ30201 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HFEQ30201 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HFEQ30201 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HFEQ30201 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HFEQ30201 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HFEQ30201 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HFEQ30201 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HFEQ30201 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HFEQ30201 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HFEQ30201 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HFEQ30201 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HFEQ30201 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HFEQ30201 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HFEQ30201 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HFEQ30201 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HFEQ30201 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HFEQ30201 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HFEQ30201 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HFEQ30201 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HFEQ30201 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HFEQ30201 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HFEQ30201 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HFEQ30201 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms