Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC57Q2TAC2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms