Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms