Protein–RNA interactions for Protein: Q16678

CYP1B1, Cytochrome P450 1B1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP1B1Q16678 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP1B1Q16678 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms