Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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