Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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