Protein–RNA interactions for Protein: Q16514

TAF12, Transcription initiation factor TFIID subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF12Q16514 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF12Q16514 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms