Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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