Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYTH1Q15438 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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