Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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PDK1Q15118 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
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PDK1Q15118 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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PDK1Q15118 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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PDK1Q15118 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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PDK1Q15118 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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PDK1Q15118 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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PDK1Q15118 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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PDK1Q15118 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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