Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms