Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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