Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms