Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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