Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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