Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
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