Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
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